商标注册是存在风险的，同样商标转让也是有风险的。
(1)非法转让，所谓非法转让注册商标是指商标转让人并不是该注册商标的所有人，或者是不能代表全部商标所有人，或者未经注册商标权利所有人同意，而以隐瞒、欺诈、伪造等不正当手段将其注册商标偷偷转让的。由于现有的商标转让程序存在漏洞，要做非法转让商标并不困难，虽然事后可以通过法律途径解决和保护商标权利人的利益，但商标受让当事人所遭受的损失将难以挽回。
(2)无效转让，所谓无效转让就是指注册商标的转让不符合商标法律所规定的限制条件，虽然商标转让双方已签订了商标转让协议，并且乙方也已支付了商标转让费，但该注册商标转让申请根本不可能被国家商标局核准，因此，该商标的转让是无效的，因为商标无法被核准转让，所以商标的所有人仍然没有变。由于国家商标局办理注册商标转让审核的周期至少要半年，并可能需一年以上的时间，再加上转让双方谈判协商商标转让价格，文件往来等等。因此，商标转让协议签订后，受让方并无法立即确定该被转让商标是否能被国家商标局核准转让注册，起码需要有六个月以上的时间。
(3)部分转让，所谓部分转让就是指注册商标的转让人，未将与被转让商标权利相关的其他同类近似商标一并转让给商标受让人，而是有意或无意的保留或隐瞒了一部分与转让商标相近似的同类商标，转让人在商标转让之后仍可以使用与被转让商标相近似的其他商标，对商标受让人造成了实质性的伤害。
(4)隐瞒被转让商标的权益漏洞，商标转让人在转让该商标时，隐瞒了该商标在转让之前已经被许可他人使用、被质押抵债、被转让等等问题，使得商标受让人在受让商标后的商标转让协议的内容主要有以下：①转让双方的名称、主体资格证明、地址、联络方式等；②被转让商标的详细资料；③商标的转让价格和付款方式；④商标转让人的权利与义务；⑤标受让人的权利与义务；⑥同的解除；⑦纷的处理方式；⑧其他约定事宜；⑨双方签字盖章